A Connecticut állambeli Danburyben született, Mary Brandis tanár és személyi edző, valamint Gregory Brandis élelmiszerforgalmazó és tűzoltó egyetlen gyermekeként. Gyermekmodellként kezdte karrierjét, majd később felkeltette figyelmét a színészet.
Hatéves korában megkapta Kevin Buchanan szerepét az One Life to Live sorozatban. Kilencéves korában Los Angelesbe költözött szüleivel, majd vendégszerepelt több sorozatban is: L.A. Law, Ki a főnök? Gyilkos sorok, The Wonder Years, Bír-lak és Kate & Allie. Tizennégy éves korában kapta élete első komolyabb filmszerepét, Bastian Balthazar Buxot alakította a Végtelen történet 2. című kalandfilmben. Ugyanebben az évben játszotta William „Dadogós Bill” Denbrough szerepét Stephen King Az című regénye alapján készült azonos című kétrészes minisorozatban. 1992-ben A bajnok és a kölyök című filmben szerepelt Chuck Norris, illetve a Katicák, avagy hajrá, csajok! című filmben Rodney Dangerfield oldalán.
Tizenhét éves korában kapta meg egyik legjelentősebb szerepét, Lucas Wolenczakot alakíthatta Steven Spielberg SeaQuest DSV – A mélység birodalma című sorozatában. A sorozatnak köszönhetően tinibálvány lett, látható volt több magazin címoldalán. Egy alkalommal 4000 rajongó várta a stúdió előtt, akiket a biztonsági őröknek kellett távol tartani a forgatástól. A seaQuest DSV forgatása során A sziámi álom című epizód társszerzője és gyártásvezetője volt. 1994-1995 között az Aladdin című Disney-animációs sorozatban ő volt Mozenrath hangja.
A seaQuest DSV után felbukkant egy televíziós filmben (Her Last Chance) Kellie Martinnal, ezután a Szabadnak született 2. – Az új kaland tévéfilmben játszotta Randolph „Rand” Thompsont, Chris Noth-tal. 1999-ben a Jótanácsok kamaszoknak és A pokol lovasai című filmekben tűnt fel. 2000-ben játszott a Vén csajok klubja című filmben (ám az csak halála után, 2005-ben került a nézőközönség elé). 2002-ben szerepet kapott a Hart háborúja filmdrámában, ám a jeleneteket törölték. Egy évvel később egy próbaepizód, a 111 Gramercy Park szereplőjeként vállalt tévés munkát. Utolsó filmjét Harvey Keitellel és Scott Glenn-nel együtt forgatta, ez a Puerto Vallarta Squeezevolt (mely 2004-ben, halála után jelent meg). Szintén halála után mutatták be az általa rendezett The Slainville Boys című kisfilmet.
2003. november 12-én a Cedars-Sinai Medical Centerben, nyugat Hollywoodban hunyt el, miután otthonában öngyilkosságot kísérelt meg. A Los Angeles-i rendőrség az alábbi nyilatkozatot adta ki:
2003. november 11-én 23:40-kor Jonathan Brandis egy barátja felhívta a rendőrséget, miszerint a színész öngyilkosságot kísérelt meg a saját lakásában a 600-as számú lakótömbben a Detroit sugárúton. A Los Angeles-i tűzoltóság rohammentős részlege szállította be a Cedars Sinai Medical Centerbe, ahol végül belehalt sérüléseibe. Hivatalos halálának ideje 2003. november 12. 14 óra 45 perc.
Nem hagyott búcsúlevelet, de barátai elmondása szerint depressziós volt a karrierje miatt, amely az elmúlt években folyamatosan hanyatlott. Az egyik barátja szerint erősen ivott és korábban meg is említette, hogy öngyilkos lesz. Brandis véleménye szerint a Hart háborúja visszahozhatta volna a köztudatba és a filmiparba, de szerepe végül ki lett vágva a filmből.
Forrás: wikipédia, listal.com
